桶裝水中銅綠假單胞菌檢測方法的比較
- 發(fā)布時間:2016-07-03
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桶裝水中銅綠假單胞菌檢測方法的比較
作者:張淑紅,吳清平,徐曉可,張菊梅,潘寶怡、彭飛艇
(廣東省菌種保藏與應用重點實驗室,廣東省微生物應用新技術公共實驗室,廣東省華南應用微生物重點實驗室-省部共建國家重點實驗室培育基地,廣東省微生物研究所,廣東廣州 510070)
摘要:分別采用傳統(tǒng)國標GB/T 8538-2008 方法、基于OprL 基因的PCR 方法和環(huán)介導等溫擴增(LAMP)方法檢測桶裝水中的銅綠假單胞菌,比較三種方法的檢測效果。結果顯示,采集的46 份市場水樣中,用傳統(tǒng)GB8538-2008 方法檢出了3 份陽性樣品,檢出率為6.5%,檢測時間至少2 天;而PCR 和LAMP 方法都檢出4 份陽性樣品,檢出率為8.7%,并且可在24 h 內(nèi)報告結果。PCR 和LAMP 方法與傳統(tǒng)方法相比具有快速靈敏等優(yōu)點,可用于大批量水樣的快速檢測和結果初篩。
銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa)是一種重要的水源性致病菌,廣泛存在于各類型水中,對消毒劑、干燥、紫外線等理化因素具有很強的抵抗力,可引起急性腸道炎、腦膜炎、敗血癥和皮膚炎癥等疾病[1~3]。近年來,隨著全球范圍內(nèi)桶裝飲用水消費量的不斷上升,國內(nèi)外有關銅綠假單胞菌污染桶裝水的報道逐漸增多,引起了諸多學者和消費者的普遍關注
[4~10]。目前桶裝飲用水銅綠假單胞菌檢測技術方面,除傳統(tǒng)的生化培養(yǎng)外,PCR 和環(huán)介導等溫擴增技術(LAMP)等分子方法逐步建立起來,應用于水樣快速檢測中。本文通過對市場銷售的桶裝水進行抽樣檢測,比較了傳統(tǒng)培養(yǎng)法與PCR 和LAMP 方法的特點,為桶裝飲用水的快速檢測提供參考。
(全文 略)
本文抽查了廣州市場上46 份各品牌桶裝成品水,平行采用傳統(tǒng)國標、PCR 方法和LAMP 方法對銅綠假單胞菌進行檢測。結果發(fā)現(xiàn),傳統(tǒng)國標方法GB8538-2008 檢出3 份陽性樣品(8#、19#和22#),而PCR 和LAMP 方法結果一致,都可以檢出4 份陽性樣品(2#、8#、19#
和22#)。三種檢測方法對8#、19#和22#樣品的檢測結果吻合,2#樣品采用傳統(tǒng)的膜過濾和平板培養(yǎng)方法未檢出,但是經(jīng)過PCR 產(chǎn)物測序證明樣品中存在銅綠假單胞菌。造成這種差異結果的原因主要有兩方面,一方面,分析可能是銅綠假單胞菌處于逆境下的不可培養(yǎng)態(tài)。另一方面,在桶裝水中大量死菌存在時PCR可以檢測出(PCR 靈敏度約為103 cfu/mL),而傳統(tǒng)方法分離不到,PCR 檢測結果假陽性。事實上,按照國家標準要求,我國飲用水處理工廠的水源水和水處理工藝相對嚴格,銅綠假單胞菌不可能達到很高的數(shù)量,成品水中存在大量死菌的情況比較少,因此,PCR 檢測結果是假陽性的可能性較小,基本是由于活菌數(shù)量增長檢測出的結果。很多情況下,銅綠假單胞菌經(jīng)過水源水消毒,管道消毒和臭氧消毒后,其活力會大大降低,處于非可培養(yǎng)狀態(tài),導致傳統(tǒng)方法培養(yǎng)不出和檢測結果的假陰性,另外,在受到水中其他雜菌的抑制時也可能導致檢測結果的假陰性[16~17]。鑒于此,本文在利用PCR 和LAMP 方法時進行了一定時間增菌(前期試驗發(fā)現(xiàn)18 h 是兩種檢測方法最低的增菌時間),以盡量避免或減少檢測結果假陰性。綜合比較三種檢測方法可以看出,傳統(tǒng)方法的檢測周期較長,至少2 天報告結果,檢測靈敏度低,而PCR 和LAMP 方法都可以在24 h 內(nèi)完成樣品檢測,具有簡便、快速、靈敏等特點。PCR 方法整個過程約需要22 h(包括過濾1 min、增菌18 h、過濾1 min、DNA 提取15 min、PCR 擴增3 h、電泳0.5 h);LAMP方法整個檢測時間約為19 h(包括過濾1 min、增菌18 h、DNA 提取15 min、LAMP 擴增45 min)。與其他方法相比,LAMP 方法操作更簡單,不需昂貴儀器,僅水浴鍋就可以完成,且結果可用肉眼直接觀察,已被成功應用于各種食源性致病菌的快速檢測[18~19]。同樣,在水樣檢測方面,為提高檢測效率,可以將PCR和LAMP 應用于出廠水樣銅綠假單胞菌的快速初篩。
國標法銅綠假單胞菌檢測儀器試劑:http://www.jc6jd.com/anquan/194.html